Linux Images

Linux Images zur Übung

Hinweis
Für die Installation folgender Images wird als Basissoftware Virtual Box vorausgesetzt (Extern: http://www.virtualbox.org).
Alle Linux-Installationen enthalten standardmäßig die Möglichkeit mit Python, Perl, C, C++ (gcc Compiler) zu programmieren.

elementary OS (amd64 / 2cores / 4GB RAM) (2020)
Hardwarevoraussetzungen: Quad-Core CPU, 8 GB RAM

Basissystem: elementary OS 5.1.2 hera (ca. 4.29 GB)
Software im Grundsystem:

• • Brave-Browser (beta)
  • Chromium-Browser (Linux Variante von Googles Chrome Browser)
  • Docker Community Edition 19.03.8
  • Virtual Box Guest Addition 6.0.18
  • Velvet Assembler (Extern: https://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet)
  • samtools (Extern: https://www.htslib.org/download)
  • hisat2 (Extern: https://daehwankimlab.github.io/hisat2/)
  • vim, emacs, build-essential Pakete, Kernel 5.3.0-x
  • terminator  (Extern: https://terminator-gtk3.readthedocs.io/en/latest/)

MEGA-Link: https://mega.nz/file/YDBkXKYJ#NWuSDW1EI6KYO32kXgU307VV73itrShhiMRVlKmWeBc

Xubuntu 18.04 (ca. 2.7 GB)
Software im Grundsystem:

• • Standard Xubuntu Installation (Libreoffice 6,Firefox, Thunderbird etc.)
  • Velvet Assembler (Extern: https://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet)
  • samtools (Extern: https://www.htslib.org/download)
  • hisat2 (Extern: https://daehwankimlab.github.io/hisat2/)
  • vim, build-essential, Kernel 4.15.0-x, git, snapd

Sciebo-Link: https://ruhr-uni-bochum.sciebo.de/s/mWEoIIUFI7A96g3

Debian 10 buster (no-GUI) (ca. 950MB)
Empfohlen für schwächere Systeme (z.B. Dualcore, 4GB RAM)
Software im Grundsystem:

• • Velvet Assembler (Extern: https://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet)
  • samtools (Extern: https://www.htslib.org/download)
  • hisat2 (Extern: https://daehwankimlab.github.io/hisat2/)
  • vim, build-essential, Kernel 4.19.x, git

MEGA-Link: https://mega.nz/file/cSQzRKYR#-mEgJrliHqHwpo9hhGFLalKKhm5CMmXTXNkqbzw3HuU

Debian 10 buster (GUI) (ca. 2GB)
Software im Grundsystem:

• • Velvet Assembler (Extern: https://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet)
  • samtools (Extern: https://www.htslib.org/download)
  • hisat2 (Extern: https://daehwankimlab.github.io/hisat2/)
  • vim, build-essential, Kernel 4.19.x
  • openbox, tint2, plank, thunar, Sublime-Text, Java 11, git
  • terminator  (Extern: https://terminator-gtk3.readthedocs.io/en/latest/)

MEGA-Link: https://mega.nz/file/9HAznaIJ#Lf2rXUEfWEaNTVmh3u6_ROcTuOvfbAdBLsm96EHdT-0

Debian 10 buster (GUI) (ca. 3.8GB) (2021)
Software im Grundsystem:

• • Velvet Assembler (Extern: https://www.ebi.ac.uk/~zerbino/velvet)
  • samtools (Extern: https://www.htslib.org/download)
  • hisat2 (Extern: https://daehwankimlab.github.io/hisat2/)
  • vim, build-essential, Kernel 4.19.x
  • openbox, tint2, plank, thunar, Java 11, git
  • terminator  (Extern: https://terminator-gtk3.readthedocs.io/en/latest/)
  • R 4.1.1 / Rstudio mit BiocManager 3.14

Sciebo-Link: https://ruhr-uni-bochum.sciebo.de/s/R7zlsXujtTx6LSr